Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A8Q9Y2E8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A8Q9Y2E8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms