Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHOC2Q9UQ13 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHOC2Q9UQ13 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOC2Q9UQ13 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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