Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN42

ATP1B4, Protein ATP1B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B4Q9UN42 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP1B4Q9UN42 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP1B4Q9UN42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP1B4Q9UN42 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ATP1B4Q9UN42 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms