Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms