Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP17Q9ULZ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP17Q9ULZ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms