Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCC3Q9ULS5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCC3Q9ULS5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms