Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDRG4Q9ULP0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDRG4Q9ULP0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms