Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH7Q9ULB5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH7Q9ULB5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms