Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3Q9UKS6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PACSIN3Q9UKS6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms