Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms