Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJD2Q9UKL4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJD2Q9UKL4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms