Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCTN4Q9UJW0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCTN4Q9UJW0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms