Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMS3Q9UJD0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms