Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13Q9UHV7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MED13Q9UHV7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms