Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
MLH3Q9UHC1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MLH3Q9UHC1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
MLH3Q9UHC1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms