Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms