Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EIF3KQ9UBQ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms