Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms