Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD3Q9P035 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms