Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TMOD2Q9NZR1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms