Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPG21Q9NZD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms