Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGA3Q9NZ52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA3Q9NZ52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms