Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms