Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC10Q9NYD6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 369 ms