Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VNN3Q9NY84 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms