Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPD3Q9NY59 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPD3Q9NY59 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms