Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNAU1APQ9NX07 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNAU1APQ9NX07 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNAU1APQ9NX07 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms