Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2orf42Q9NWW7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms