Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX18Q9NVP1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX18Q9NVP1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms