Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM39AQ9NV64 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms