Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SAMSN1Q9NSI8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms