Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC6A13Q9NSD5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms