Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPORSQ9NS56 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOPORSQ9NS56 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms