Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM1Q9NRU3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM1Q9NRU3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNNM1Q9NRU3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms