Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms