Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD2Q9NRG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD2Q9NRG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms