Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNGB3Q9NQW8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms