Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMRT3Q9NQL9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMRT3Q9NQL9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms