Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CRTAC1Q9NQ79 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRTAC1Q9NQ79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTAC1Q9NQ79 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms