Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASCL3Q9NQ33 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms