Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM138Q9NPI0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM138Q9NPI0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms