Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF12AQ9NP84 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF12AQ9NP84 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms