Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTA1Q9NP79 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms