Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCX3AQ9NNX9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VCX3AQ9NNX9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms