Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA4Q9HCM2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNA4Q9HCM2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms