Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX8Q9HC52 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms