Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC24

TMBIM4, Protein lifeguard 4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM4Q9HC24 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMBIM4Q9HC24 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMBIM4Q9HC24 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms