Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERVMER34-1Q9H9K5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms