Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF408Q9H9D4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF408Q9H9D4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms