Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf42Q9H799 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C5orf42Q9H799 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms